近日,无锡市人民医院医学检验科首次独立完成了2例新冠病毒基因分型鉴定测试,成为江苏省内为数不多可以开展新冠测序的医院。此举标志着检验检测技术迈上了新台阶,实现了分子生物学应用、研究等里程碑式的跨越。
火眼金睛!
强化预警监测
当前人类面临的病原微生物种类繁多。早发现、早防控、早溯源、早分型是高致病性和高传播力防治的关键。变异毒株快速分型检测和监测就像是“齐天大圣”斗妖魔时的“火眼金睛”,在预判高致病毒株的发生、传播中发挥重要作用。为了做好快速病原微生物变异监测,强化保障人民群众健康的预警作用,无锡市人民医院医学在邹健主任的带领下开展了深入的科学研究和前期建设。科室结合自身优势和人才储备,持续强化能力建设;参照国家标准,在现有微生物专业组和分子检测平台的基础上,重点强化感染性疾病的检测和鉴定能力。
此次独立完成的新冠病毒阳性样本分型,均为奥密克戎变异株。此技术水平属于全省前列,展现了医院超强的检测能力。
宏基因组!
满分通过质评
基于二代高通量技术(mNGS)对于高致病性病原体的早期发现、防控方案的制定及病毒的溯源发挥巨大的作用。
2022年12月无锡市人民医院医学检验科短期内迅速完成了基于现有二代测序仪(MGISEQ200)、全自动前处理(MGISP100)等设备的宏基因组检测平台的搭建,通过3个月紧张的人员培训和预实验,已初步掌握对新发及复杂性感染性疾病病原微生物的检测能力。
病原微生物宏基因组检测技术要求具备严格的质量控制。为确保医院宏基因组检测平台具备较高的质控水平,无锡市人民医院在平台搭建后迅速参加了上海临检中心组织的血浆微生物游离DNA宏基因组测序室间质评,并满分通过,证明平台的质量控制和运行的有效性。
精准检测!
搭建基因平台
目前,无锡市人民医院医学检验科已具备对常见微生物的培养鉴定和PCR分子检测能力,以及基于二代测序技术的病原体及代表性耐药和毒力基因检测的综合检测能力,强化了各种感染性疾病的应对能力,高效搭建PMseq?病原微生物基因检测本地化平台。
邹健主任介绍,检验人员基于宏基因组学技术,提取标本中全部核酸,经不同的样本前处理,在高通量测序平台上进行测序,并通过专用高质量临床数据库(PMDB)比对和智能化算法分析,获得疑似致病微生物的种属信息。
该平台可无偏性地检测细菌、真菌、病毒、寄生虫等17500种病原体及代表性耐药和毒力基因,显著提高病原诊断阳性率,进而指导临床医生靶向使用抗生素,协助感染患者的精准诊疗。
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